解答：
《財政部 國家稅務總局關于增值稅若干政策的通知》(財稅[2005]165號)“六、一般納稅人注銷時存貨及留抵稅額處理問題”規(guī)定：一般納稅人注銷或被取消輔導期一般納稅人資格，轉為小規(guī)模納稅人時，其存貨不作進項稅額轉出處理，其留抵稅額也不予以退稅。
在企業(yè)注銷前，存在留底稅額的，可能存在兩種情況：1、注銷前還存在存貨、固定資產等非貨幣性資產;2、注銷前已經不存在非貨幣性資產。
在企業(yè)注銷前，如果還存在非貨幣性資產的，需要銷售變現(xiàn)或者分配給股東(投資者)等，無論是銷售還是分配等視同銷售，都會產生增值稅銷項稅額，留抵稅額應先從銷項稅額抵扣。
如果抵扣后還有留抵稅額，或注銷前已經不存在非貨幣性資產但有留抵稅額的，企業(yè)在按照《財政部 國家稅務總局關于企業(yè)清算業(yè)務企業(yè)所得稅處理若干問題的通知》(財稅[2009]60號)清算的所得稅處理時，可以依法減除。
企業(yè)的全部資產可變現(xiàn)價值或交易價格，減除資產的計稅基礎、清算費用、相關稅費，加上債務清償損益等后的余額，為清算所得。
《企業(yè)所得稅法實施條例》(國務院令第512號)第三十一條規(guī)定，企業(yè)所得稅法第八條所稱稅金，是指企業(yè)發(fā)生的除企業(yè)所得稅和允許抵扣的增值稅以外的各項稅金及其附加。
因此，企業(yè)注銷前還有的留抵稅額就是上述“允許抵扣的增值稅以外的各項稅金”，可以作為“相關稅費”，在計算清算所得時減除。
2014年10月的解析——
企業(yè)注銷時留抵增值稅不予退稅但可扣除
福建A公司是增值稅一般納稅人。受經營管理不善及市場不景氣等因素影響，A公司常年處于虧損狀態(tài)。盡管采取了挽救措施，但仍未出現(xiàn)轉機。A公司董事會經討論，一致決定結束公司經營活動，進行企業(yè)注銷清算。在清算過程中，發(fā)現(xiàn)尚有100萬元的庫存商品未銷售，增值稅留抵稅額8萬元。
A公司財務人員想知道，公司清算注銷時，100萬元存貨相應的進項稅額14.5萬元需要轉出并補稅嗎？留抵稅額8萬元能否申請辦理退稅？
《財政部、國家稅務總局關于增值稅若干政策的通知》(財稅〔2005〕165號)第六條規(guī)定，一般納稅人注銷或被取消輔導期一般納稅人資格，轉為小規(guī)模納稅人時，其存貨不作進項稅額轉出處理，其留抵稅額也不予以退稅。
因此，一般納稅人清算注銷時，若仍有存貨未銷售，且其增值稅進項稅額已被全部抵扣的，該存貨相應的進項稅額無須作進項稅額轉出而予以補稅。當然，若存在留抵稅額的，該留抵稅額也不能辦理退稅。根據(jù)上述規(guī)定，A公司清算注銷前100萬元未銷售的庫存商品不需轉出進項稅額，也不需要補稅，留抵稅額8萬元不能申請辦理退稅。
另根據(jù)企業(yè)所得稅法第八條和企業(yè)所得稅法實施條例第三十一條的規(guī)定，企業(yè)發(fā)生的除企業(yè)所得稅和允許抵扣的增值稅以外的各項稅金及其附加，準予在計算應納稅所得額時扣除。
雖然A公司注銷時留抵的增值稅進項稅額8萬元不能予以退稅，但在計算應納稅所得額時是準予扣除的。